トップリーグと完全に独立したプロリーグのこと。
米国における野球の独立リーグではメジャーリーグやマイナーリーグを自由契約になった選手、あるいはメジャーを目指している選手が独立リーグでプレーすることが多い。市場規模は小さく、地方都市で展開され、地方により様々なリーグが存在している。
日本の野球界では2009年現在、四国九州アイランドリーグ、ベースボールチャレンジリーグ、関西東海独立リーグの3リーグが運営されている。関西東海独立リーグでは、史上初の女子プロ野球選手も誕生した。
